1625-1627 г.г. - построена новая деревянная церковь Живоначальной Троицы.
1667г. - строится каменная церковь Живоначальной Троицы в Останкине.
03 февраля 1683 г. - освящен северный придел во имя Тихвинской иконы Божией Матери.
01 августа 1691 г. - освящен южный придел во имя св. Александра Свирского.
03 июня 1692 г. - освящен центральный придел во имя Живоначальной Троицы , этим же годом датируется иконостас.
Июль 1730 - проездом в Троицкий монастырь, посещает усадьбу Черкасских императрица Анна Иоановна.
1742 г. (10 и 20 июля, 28 сентября и 27 октября) - посещает усадьбу и храм Елизавета Петровна.
1767 г. - изменяется внешний облик храма, возобновляется иконостас, появляются новые иконы, новые святыни.
1851 г. - храм вновь ремонтируется, реставрируется, резко изменяется состав иконостаса, заново расписываются стены, расписана паперть, на следующий год главный алтарь.
1856 г. - в храме Живоначальной Троицы в Останкине говеет при восшествии на престол император Александр Второй с семьей.
Лето 1866 г. - в Останкино была привезена чудотворная икона Иверской Божией Матери.
1878- 1880 гг.– храм капитально реставрируется, пристраивается колокольня. Храм причисляют к памятникам архитектуры и зодчества.
1919 г. - приход по бедности и малолюдству спускается из верхних храмов в подклет, где был освящен престол во имя св. Николая.
23 апреля 1922 г. из храма изымаются ценности.
1930 г. приход был упразднен, а храм перешел во владение Антирелигиозного музея искусств совместно с финансовым отделом Дзержинского района Москвы.
1935 г. - музей получает храм в свое ведение. Церковь демонстрируется музеем как памятник архитектуры XVII века. С начала Великой Отечественной войны музей был закрыт, в храм перенесли все наиболее ценное имущество из дворца; с тех пор помещение храма служило хранилищем.
В 1970-е годы началась реставрация.
23 марта 1991 г. Святейший Патриарх Московский и всея Руси АлексийII освятил престол в честь Святой Живоначальной Троицы .
31 декабря 1994 г. архиепископ Владимирский и Суздальский Евлогий освятил южный придел во имя св. прп. Александра Свирского.
14 августа 1996 г. архиепископ Истринский Арсений освятил северный придел во имя Тихвинской иконы Божией Матери.
